上海分院是为实施大市场、大开放、大发展的战略而组建的，是山东省医药工业设计院派驻上海的分支机构，负责南方市场的业务拓展、开发与生产。
    近年已完成的主要项目
    ·广东雷允上药业有限公司GMP技术改造项目
    ·江西三九药业有限公司GMP易地改造项目
    ·上海克仑生物工程有限公司项目
    ·广东新科迪药业有限公司新厂建设项目
    ·上海百棵药业有限公司新厂建设项目
    ·香港美达药业公司制剂车间技术改造项目
    ·美施威尔（上海）有限公司技术服务项目
    ·上海新亚药业有限公司冻干粉针车间GMP技术改造项目
    ·苏州集琦方舟基因药业有限公司技术改造项目
    ·上海新亚闵行有限公司技术改造项目